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Gaussian進行過渡態搜索

2021-04-19  ChemAurum

    研究過渡態的結構在化學中是非常重要的內容,無論是確定反應的方向、勢壘高度、反應路徑等,都需要計算過渡態能量。在Gaussian軟件中,過渡態能夠非常方便的進行結構優化與振動分析。

    下面我們以氫氧根對氟甲烷的親核取代為例,練習如何使用QST2方法進行過渡態搜索。

    QST2需要繪制基元反應的反應物與產物的結構,并使用鏈接編輯器(在Gaussian面板上像是一個鎖鏈)將反應前后的原子一一對應。可以使用Autofixing進行自動對應,但是有時候自動對應會出錯,這時就需要手動對原子進行序號的對應。

    接著設置計算任務,選擇Opt+freq,方法使用DFT,B3LYP,這里使用的基組是6-31G(p)。原諒我為了節省時間采用了小基組)

    計算結果中Results→Vibrations打開振動分析器,出現的正確結果應該是有一個虛頻(即負的振動頻率,意味著勢能面的鞍點,即過渡態結構),點擊Animation,可以看到勢能面上過渡態兩側振動的結構,可以用于初步判定是否是合理的過渡態結構。

    振動模擬的結果如下:

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